これ、Windows 7から乗り換えた身としてはどういうことか全く理解できませんでしたが、Windows 10自体の機能でした。
ちなみに、Chromeをスタートアップに入れているわけではありません。

・再起動すると再起動前に起動していたアプリが自動的に起動する
https://answers.microsoft.com/ja-jp/windows/forum/apps_windows_10-winapps-appscat_productivity/%E5%86%8D%E8%B5%B7%E5%8B%95%E3%81%99%E3%82%8B/3a2305ea-07e8-4d3d-a465-aa0ba949b13d?msgid=ddc6cbda-09f3-4242-a2b2-ecaa70c06350

上記の質問スレによると、Windows10のFall Creators Update(FCU;1709)を利用している場合は起こるようだ。
そもそも、Fall Creators Update(FCU;1709)って何？っていうのは以下とかを参照。

https://www.microsoft.com/ja-jp/itpro/windows-10/release-information

上記を引用すると、

・Windows 10 のリリース履歴
Version 1803 (OS build 17134)
Version 1709 (OS build 16299)
Version 1703 (OS build 15063)
Version 1607 (OS build 14393)
Version 1511 (OS build 10586)
Version 1507 (RTM) (OS build 10240)

のようです。ちなみにビルド番号は、コルタナの検索ボックスから「システム情報」と検索すると、以下のような画面が立ち上がりますので、右ペインの上部で確認できます。

私の場合は16299なので、Windows 10の1709のようですね。
話を戻しますが、スレによるとこれは設定では自動起動を変更できないらしい・・・。
OSシャットダウン時の状態によるらしいから、自分で落とすとかすればいんでしょうけどね。

リソースに余裕のあるPCを前提とした機能かなー。
自分とかはいいですが、Windows 7からアップグレードしたPCやぎりぎりのスペックを使っている場合などはつらいかもしれないですね。